65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0842 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
276 aa  550  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  72.97 
 
 
260 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  73.31 
 
 
279 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  76.72 
 
 
260 aa  357  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  76.72 
 
 
260 aa  357  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  77.16 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  70.27 
 
 
279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  74.57 
 
 
260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  73.03 
 
 
260 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  68.11 
 
 
259 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  71.08 
 
 
259 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  76.62 
 
 
260 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  73.71 
 
 
260 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  73.31 
 
 
256 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  63.39 
 
 
279 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  72.73 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  72.73 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  72.73 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  65.48 
 
 
256 aa  318  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  72.49 
 
 
260 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  72.49 
 
 
260 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  72.49 
 
 
260 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  71.86 
 
 
260 aa  314  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  63.52 
 
 
259 aa  298  8e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  58.33 
 
 
268 aa  278  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  58.57 
 
 
263 aa  271  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.62 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  52.74 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  54.15 
 
 
263 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  54.59 
 
 
263 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  50.21 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  48.48 
 
 
278 aa  215  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  49.17 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  46.18 
 
 
263 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  44.14 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 
261 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  38.8 
 
 
229 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  39.25 
 
 
258 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 
258 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  39.25 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  39.91 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  39.46 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  31.16 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.76 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.76 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  34.63 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  32.43 
 
 
236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  34.2 
 
 
230 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  33.81 
 
 
226 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  33.33 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  24.74 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  29.44 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.12 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.98 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.98 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.98 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.46 
 
 
265 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  28.12 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.64 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.97 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4885  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.47 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1356  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.16 
 
 
253 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  26.59 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  24.49 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1377  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.98 
 
 
249 aa  42  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>