80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4414 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 274 aa  544  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  72.5 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  74.37 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  58.3 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  59.07 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  53.69 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  53.25 
 
 		 263 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  54.55 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  50.61 
 
 		 279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  51.01 
 
 		 279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  51.72 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  51.93 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  53.02 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  53.02 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  53.02 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  49.39 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  51.05 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  52.81 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  53 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  49.17 
 
 		 276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.34 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  44.22 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  47.11 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  45.7 
 
 		 259 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  47.3 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  47.74 
 
 		 256 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  52.81 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  52.81 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  52.81 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  52.81 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  52.84 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  52.84 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  52.84 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  48.72 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  45.89 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  45.7 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  45.7 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  45.16 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  39.32 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  40.57 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  41.62 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.43 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  39.36 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  40.69 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  41.49 
 
 		 235 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  41.62 
 
 		 230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  41.62 
 
 		 226 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.05 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  33.86 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  25.96 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  32.03 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.23 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.38 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3828  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  25.42 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.56 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2756  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  26.38 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0851797  normal  0.0478662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1419  molybdate transporter periplasmic protein  25.69 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2937  molybdate transporter periplasmic protein  25.69 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2850  molybdate transporter periplasmic protein  25.69 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1303  molybdate transporter periplasmic protein  24.05 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  31.9 
 
 		 183 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  24.41 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  25.42 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.95 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2037  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.76 
 
 		 250 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3871  ABC molybdate transporter, periplasmic binding protein ModA  25.74 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.609422  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4169  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.74 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000521037  normal  0.0708961 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  26.94 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  25.1 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0106  putative molybdate-binding periplasmic signal peptide protein  26.21 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.24 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.22 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5198  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.79 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.5 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3545  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.41 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02318  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.14 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.689818  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01600  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.658672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1837  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.46 
 
 		 254 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62263  hitchhiker  0.0054087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>