92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2276 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  59.92 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  63.14 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  58.51 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  61.04 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  58.57 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  57.71 
 
 		 279 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  57.71 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  60 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  60.78 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  58.57 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  56.49 
 
 		 278 aa  265  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  60.34 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  59.91 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  59.91 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  59.48 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  56.22 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  58.65 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  60.61 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  53.9 
 
 		 279 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  54.12 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  52.34 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  52.92 
 
 		 259 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  51.82 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  56.54 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  59.31 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 		 268 aa  245  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  59.31 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  59.31 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  58.87 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  59.39 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  59.39 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  59.39 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  53.56 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  49.57 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  44.4 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  39.91 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  38.43 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  37.19 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  39.35 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  36.91 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  37 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  37.84 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  44.92 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  41.08 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  39.91 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.87 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  38.1 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  35.64 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  30.51 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  30.98 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  29.72 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.69 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.78 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  33.61 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0340  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.1 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0790  molybdate transporter periplasmic protein  26.52 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0684  molybdate transporter periplasmic protein  26.52 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2879  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.52 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0817  molybdate transporter periplasmic protein  26.52 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.83 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2899  molybdate transporter periplasmic protein  26.52 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00185371  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0786  molybdate transporter periplasmic protein  26.52 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0866  molybdate transporter periplasmic protein  26.14 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.39 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0435  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.97 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0433455  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4477  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.38 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.763394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2756  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  24.47 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0851797  normal  0.0478662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4941  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3065  molybdate transporter periplasmic protein  23.92 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1269  molybdate transporter periplasmic protein  23.92 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2037  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.06 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.6 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1377  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.52 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2028  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.79 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05725  ABC-type molybdate transport system periplasmic component  24.62 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0809  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.13 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4560  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.74 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4418  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.08 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0979  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.16 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  22.69 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  23.33 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1254  molybdate transporter periplasmic protein  24.24 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.894864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2474  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.96 
 
 		 260 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3828  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  24.19 
 
 		 252 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3124  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.77 
 
 		 251 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01300  periplasmic molybdate-binding protein, ModA2  24.86 
 
 		 252 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>