84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2708 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  99.62 
 
 
260 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  99.23 
 
 
260 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  99.23 
 
 
260 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  96.54 
 
 
260 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  72.69 
 
 
260 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  68.99 
 
 
279 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  68.73 
 
 
279 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  71.9 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  67.31 
 
 
260 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  70.38 
 
 
260 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  68.85 
 
 
260 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  68.85 
 
 
260 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  68.46 
 
 
260 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  66.54 
 
 
260 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  68.46 
 
 
276 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  64.34 
 
 
259 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  65.45 
 
 
259 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  68.87 
 
 
256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  65.49 
 
 
279 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  63.14 
 
 
256 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  58.06 
 
 
268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  61.97 
 
 
259 aa  280  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  58.23 
 
 
263 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.41 
 
 
264 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  56.65 
 
 
263 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  55.79 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  53.39 
 
 
273 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  52.99 
 
 
283 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  50.63 
 
 
278 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  51.23 
 
 
274 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  48.26 
 
 
263 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  44.06 
 
 
267 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  40 
 
 
219 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  43.26 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  41.71 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  41.71 
 
 
258 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  41.18 
 
 
272 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  38.2 
 
 
229 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  41.94 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  39.61 
 
 
235 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  38.91 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  40.11 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  39.25 
 
 
235 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  39.78 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  37.62 
 
 
226 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  30.34 
 
 
231 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  40.32 
 
 
230 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  33.77 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2848  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.48 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.18 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  27.57 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  28.15 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6804  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.1 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000025189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2037  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.12 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.82 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4885  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.08 
 
 
290 aa  48.9  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.82 
 
 
289 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.82 
 
 
289 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4418  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.63 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664379  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3359  hypothetical protein  26.79 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  26.69 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4405  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.06 
 
 
259 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216941  normal  0.212386 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3851  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.4 
 
 
261 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133197  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3965  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.4 
 
 
261 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000683458  normal  0.0526206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.2 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4313  hypothetical protein  27.11 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  27.24 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.24 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0106  putative molybdate-binding periplasmic signal peptide protein  26.59 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.37 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.11 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  26.47 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.73 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.24 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.82 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3871  ABC molybdate transporter, periplasmic binding protein ModA  25.74 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.609422  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4169  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.74 
 
 
258 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000521037  normal  0.0708961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.64 
 
 
252 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.86 
 
 
251 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>