82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3268 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
278 aa  547  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  85.42 
 
 
283 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  72 
 
 
274 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  60.98 
 
 
273 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  58.47 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  54.37 
 
 
263 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  59.66 
 
 
263 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  57.83 
 
 
263 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  50.39 
 
 
279 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  50.78 
 
 
279 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.08 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  51.26 
 
 
260 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  52.56 
 
 
260 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  52.14 
 
 
260 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  52.56 
 
 
260 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  52.56 
 
 
260 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  52.56 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  51.28 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  50.42 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  51 
 
 
279 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  51.59 
 
 
256 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  51.06 
 
 
256 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  47.58 
 
 
259 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  48.35 
 
 
276 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  46.77 
 
 
259 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  48.54 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  44.72 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  50.43 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  50.43 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  50.43 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  50.43 
 
 
260 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  50.43 
 
 
260 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  50.43 
 
 
260 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  44.1 
 
 
263 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  40.6 
 
 
229 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  37.86 
 
 
258 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 
258 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  37.86 
 
 
272 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  38.26 
 
 
233 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.09 
 
 
235 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  42.47 
 
 
236 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  42.47 
 
 
219 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  44.09 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  43.32 
 
 
226 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  38.96 
 
 
230 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.74 
 
 
235 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.1 
 
 
235 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  32.45 
 
 
229 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  30.46 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  25.32 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  24.9 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2756  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.85 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0851797  normal  0.0478662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.9 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.42 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.42 
 
 
232 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.02 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  25.51 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.97 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.45 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  30.4 
 
 
183 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3828  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  24.17 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  24.27 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.08 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0106  putative molybdate-binding periplasmic signal peptide protein  25.37 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173148 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0782  molybdate-binding periplasmic protein precursor ModA  26.73 
 
 
244 aa  45.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.657467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1520  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.14 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0302471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0979  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.27 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01300  periplasmic molybdate-binding protein, ModA2  25 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  25.3 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1356  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.47 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1443  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.41 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1837  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.98 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62263  hitchhiker  0.0054087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3545  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.51 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2037  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.14 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  19.01 
 
 
256 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.51 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3871  ABC molybdate transporter, periplasmic binding protein ModA  24.07 
 
 
258 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.609422  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4169  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.07 
 
 
258 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000521037  normal  0.0708961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2474  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.43 
 
 
260 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>