99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6283 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
264 aa  527  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  59.92 
 
 
263 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  60.61 
 
 
263 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  56.28 
 
 
263 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  53.57 
 
 
279 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  52.78 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 
260 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  54.27 
 
 
260 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  54.98 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  54.98 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  52.34 
 
 
260 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  54.55 
 
 
260 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  51.68 
 
 
279 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  53.85 
 
 
260 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  54.55 
 
 
260 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  53.39 
 
 
273 aa  255  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  51.57 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  48.25 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  49.62 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  51.21 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  54.98 
 
 
260 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  54.98 
 
 
260 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  54.11 
 
 
260 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  54.98 
 
 
260 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  55.02 
 
 
260 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  49.18 
 
 
259 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  55.02 
 
 
260 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  55.02 
 
 
260 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  49.59 
 
 
268 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
278 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  48.79 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  49.57 
 
 
283 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  50.64 
 
 
259 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  45.73 
 
 
263 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  46.86 
 
 
274 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 
261 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  40.17 
 
 
258 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 
258 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  39.3 
 
 
272 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  40.54 
 
 
229 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  40.54 
 
 
236 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  38.6 
 
 
233 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  38.14 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.28 
 
 
235 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.82 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  37.16 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  36.17 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  39.57 
 
 
230 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.68 
 
 
235 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  32.44 
 
 
231 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  31.96 
 
 
226 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  28.64 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  30.94 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.07 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.6 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.21 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.22 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05725  ABC-type molybdate transport system periplasmic component  26.29 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3828  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  24.21 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  26.51 
 
 
252 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1482  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.19 
 
 
292 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0604693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4560  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.01 
 
 
279 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0058  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.81 
 
 
265 aa  52  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.287616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2284  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.21 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.753912  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1370  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.58 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.215303  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2331  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.17 
 
 
271 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.618234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0979  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.57 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0168  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.49 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2178  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.31 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000275297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.52 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  27.41 
 
 
183 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2821  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.66 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1377  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.19 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  23.77 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4477  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.12 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.763394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.47 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4169  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000521037  normal  0.0708961 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3871  ABC molybdate transporter, periplasmic binding protein ModA  25 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.609422  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4941  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.65 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  22.99 
 
 
250 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2756  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  24.47 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0851797  normal  0.0478662 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0328  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.98 
 
 
260 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000117  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding protein ModA  23.87 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  24.38 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.05 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1443  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.05 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2037  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.33 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0276  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.17 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0123729 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  23.2 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.2 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5514  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0252  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.04 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0743  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.79 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3863  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding protein  21.37 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3709  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.56 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2962  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding protein modA  22.98 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1020  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.67 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.73823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>