61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0167 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  100 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  63.56 
 
 
236 aa  268  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  58.22 
 
 
229 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  55.36 
 
 
258 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  54.91 
 
 
258 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  54.46 
 
 
272 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  57.53 
 
 
219 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  53.54 
 
 
235 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  56.76 
 
 
235 aa  222  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  58.11 
 
 
235 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  58.26 
 
 
230 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  48.87 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  46.58 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  47 
 
 
263 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  42.41 
 
 
232 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  43.85 
 
 
233 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  40.27 
 
 
273 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 
267 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
278 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.16 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  39.91 
 
 
263 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  40.54 
 
 
260 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  34.2 
 
 
276 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  40.43 
 
 
274 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  39.25 
 
 
260 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 
279 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  38.38 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  38.92 
 
 
279 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  38.38 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  39.46 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  40.32 
 
 
260 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 
268 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  37.43 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  40.86 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  40.32 
 
 
260 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 
256 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  40.32 
 
 
260 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  40.32 
 
 
260 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  40.32 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.22 
 
 
259 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32 
 
 
259 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  32.31 
 
 
226 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  34.59 
 
 
256 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 
261 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  29.81 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  35.57 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  28.19 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  32.77 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4560  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.19 
 
 
279 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1837  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.32 
 
 
254 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62263  hitchhiker  0.0054087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2331  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.84 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.618234 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0748  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.36 
 
 
266 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  22.65 
 
 
272 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  27.23 
 
 
252 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>