74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4319 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  64.84 
 
 		 236 aa  274  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  62.56 
 
 		 229 aa  268  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  57.34 
 
 		 258 aa  254  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  56.88 
 
 		 258 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  56.42 
 
 		 272 aa  249  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  62.1 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  57.53 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  53.64 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  54.34 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  57.99 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  50.92 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  43.62 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  43.5 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  40.47 
 
 		 260 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 260 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  40 
 
 		 260 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.14 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  43.78 
 
 		 263 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 		 263 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 		 278 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  38.6 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 		 260 aa  134  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  39.68 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  37.63 
 
 		 263 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.16 
 
 		 276 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  41.3 
 
 		 274 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  34.05 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 268 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  35.94 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  41.21 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  33.49 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  32.56 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  32.41 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  34.92 
 
 		 256 aa  111  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.09 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.91 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  33.17 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  29.19 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  28.67 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1160  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.63 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000579456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  30.95 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0410  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00464746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  19.25 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  18.78 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0813  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.76 
 
 		 263 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  26.99 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01600  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.69 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.658672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1558  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  22.66 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.455674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3425  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  21.84 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0881211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1334  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.23 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.36729  normal  0.0167209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2178  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.12 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000275297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2560  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  22.17 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403904  normal  0.205693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1370  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.11 
 
 		 262 aa  45.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.215303  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0748  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  19.89 
 
 		 266 aa  45.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02318  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.61 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.689818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4560  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.63 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119032  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1356  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.11 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2284  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.11 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.753912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0317  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.71 
 
 		 246 aa  42  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.747783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  27.48 
 
 		 251 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>