67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1278 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  68.75 
 
 		 258 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  68.3 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  67.86 
 
 		 272 aa  314  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  63.96 
 
 		 236 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  62.56 
 
 		 219 aa  268  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  58.22 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  57.66 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  56.19 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  55.86 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  55.26 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  47.51 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  41.99 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  40.6 
 
 		 278 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  39.83 
 
 		 263 aa  154  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 267 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  41.85 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  39.22 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  39.25 
 
 		 260 aa  148  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.54 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.8 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 		 263 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  36.02 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  38.15 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  38.59 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  41.76 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.33 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.1 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  41.62 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  41.62 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  41.62 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  41.62 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  41.62 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  41.62 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  40.54 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  35 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  36.72 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  34.41 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  34.81 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  34.23 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  30.06 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  25.97 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01600  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.18 
 
 		 310 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.658672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4895  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  34.67 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  21.82 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.3 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4477  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.27 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.763394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2665  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.94 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0609537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0813  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.62 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1558  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  20.19 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.455674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4941  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.93 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2560  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  19.72 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403904  normal  0.205693 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3871  ABC molybdate transporter, periplasmic binding protein ModA  24.58 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.609422  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4169  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.47 
 
 		 258 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000521037  normal  0.0708961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>