60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3414 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  45.58 
 
 
226 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  40.61 
 
 
283 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  39.91 
 
 
263 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  43.58 
 
 
263 aa  148  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  40.79 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  41.98 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.6 
 
 
264 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  39.91 
 
 
276 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 
278 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  43.26 
 
 
260 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  40.28 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  41.76 
 
 
229 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.59 
 
 
235 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  43.26 
 
 
260 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  43.66 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  43.66 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  43.66 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  43.66 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  43.26 
 
 
260 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
260 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  38.03 
 
 
263 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
260 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  41.62 
 
 
256 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  45.6 
 
 
235 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  43.85 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  39.62 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  39.57 
 
 
260 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  40.11 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  37.1 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 
260 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 
267 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  40.64 
 
 
236 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  36.56 
 
 
272 aa  125  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 
279 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 
261 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  43.48 
 
 
235 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  41.21 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  38.1 
 
 
259 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.97 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  39.57 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.43 
 
 
259 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  36.71 
 
 
209 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  40.11 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  33.87 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  31.84 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.4 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  29.41 
 
 
250 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  27.91 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2665  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.59 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0609537  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3658  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.54 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1443  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.39 
 
 
283 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  32.76 
 
 
183 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4941  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.34 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>