78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5521 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
260 aa  524  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  89.92 
 
 
279 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  89.58 
 
 
279 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  92.69 
 
 
260 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  85 
 
 
260 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  90.77 
 
 
260 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  90.38 
 
 
260 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  90.38 
 
 
260 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  88.57 
 
 
260 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  89.88 
 
 
260 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  75.88 
 
 
256 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  70.82 
 
 
259 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  72.13 
 
 
259 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  71.37 
 
 
276 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  68.87 
 
 
256 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  67.69 
 
 
260 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  67.69 
 
 
260 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  67.31 
 
 
260 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  67.31 
 
 
260 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  67.31 
 
 
260 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  67.31 
 
 
260 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  70.09 
 
 
260 aa  327  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  62.45 
 
 
279 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  63.68 
 
 
259 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  55 
 
 
268 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  58.57 
 
 
263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.73 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  57.64 
 
 
263 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  58.95 
 
 
263 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  54.24 
 
 
273 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  53.22 
 
 
278 aa  234  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  49.8 
 
 
274 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  51.52 
 
 
283 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  49.34 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  45.53 
 
 
267 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  45.93 
 
 
258 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  45.93 
 
 
258 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  45.93 
 
 
272 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  38.15 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.14 
 
 
235 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  36.05 
 
 
219 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  39.88 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  39.57 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.69 
 
 
235 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  43.04 
 
 
230 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  37.21 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.76 
 
 
235 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  38.95 
 
 
230 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  35.47 
 
 
226 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  25.68 
 
 
231 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.28 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  31.29 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.69 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.69 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.69 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.69 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  26.67 
 
 
291 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0809  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.6 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.59 
 
 
251 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.27 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.26 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4885  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.17 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0970  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  24.48 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0979  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.61 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4405  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216941  normal  0.212386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.78 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.12 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.47 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  26.36 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6804  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.39 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000025189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2848  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  23.08 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.95 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2858  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.19 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1370  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.92 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.215303  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  22.89 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3323  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.16 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0106  putative molybdate-binding periplasmic signal peptide protein  23.42 
 
 
257 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>