88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2760 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2760  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 263 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6135  extracellular solute-binding protein  82.51 
 
 		 263 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6283  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60.32 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2276  extracellular solute-binding protein  61.3 
 
 		 263 aa  292  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5624  extracellular solute-binding protein  57.26 
 
 		 279 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0979228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4981  extracellular solute-binding protein  58.47 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.894969 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6372  extracellular solute-binding protein  56.45 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0531  extracellular solute-binding protein  58.12 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6429  extracellular solute-binding protein  57.51 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6664  extracellular solute-binding protein  57.51 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6262  extracellular solute-binding protein  57.94 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853553  normal  0.357711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5521  extracellular solute-binding protein family 1  55.6 
 
 		 260 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3511  extracellular solute-binding protein  57.83 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0442496  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6011  extracellular solute-binding protein  57.51 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0544  extracellular solute-binding protein family 1  58.52 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3934  extracellular solute-binding protein  55.2 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0494971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3268  extracellular solute-binding protein  57.63 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2545  extracellular solute-binding protein  56.36 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3335  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  51.22 
 
 		 259 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3153  extracellular solute-binding protein family 1  56.07 
 
 		 273 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0842  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  53.52 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0876372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3890  putative ABC transporter  51.43 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0957291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3166  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  51.22 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3196  extracellular solute-binding protein  56.65 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3211  putative solute-binding periplasmic protein  56.65 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3157  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  56.65 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3159  extracellular solute-binding protein  55.13 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0874  hypothetical protein  56.71 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2708  hypothetical protein  56.71 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1902  hypothetical protein  56.71 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157371  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1640  extracellular solute-binding protein  47.86 
 
 		 267 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152347  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1410  extracellular solute-binding protein, putative  56.22 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4414  putative molybdate transport system substrate-binding protein  54.51 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02401  extracellular solute-binding protein, family 1  51.49 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3180  extracellular solute-binding protein  47.67 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6046  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.829296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0091  hypothetical protein  40.73 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1278  hypothetical protein  40.34 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000772108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4123  extracellular solute-binding protein  46.77 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0090  hypothetical protein  46.24 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0340  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  44.7 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3414  hypothetical protein  40.79 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6037  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  42.7 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0766944  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4319  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  43.78 
 
 		 219 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.579544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0167  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  47 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6373  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.43 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5739  putative ABC transporter, periplasmic molybdate binding protein  47.57 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7568  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  44.86 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253148  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1554  hypothetical protein  40 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0980  putative extracellular metal-binding protein  37.77 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4568  hypothetical protein  36 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.544731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0618  hypothetical protein  29.69 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4370  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.18 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  27.55 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.45 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.33 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.89 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.03 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3481  molybdate-binding periplasmic protein precursor  28.02 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2540  hypothetical protein  34.65 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.560007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  27.57 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.21 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.46 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.46 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.46 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.91 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2331  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.09 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.618234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4560  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.55 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2756  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  26.1 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0851797  normal  0.0478662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  26.97 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3828  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  26.25 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0058  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.91 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.287616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  28.17 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.71 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4885  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.73 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4477  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.38 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.763394 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4405  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.42 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216941  normal  0.212386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2080  molybdenum ABC transporter (substrate-binding protein)  27.42 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4941  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.87 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0748  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.61 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1837  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.57 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62263  hitchhiker  0.0054087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01300  periplasmic molybdate-binding protein, ModA2  24.9 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3124  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.98 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3863  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding protein  21.71 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1254  molybdate transporter periplasmic protein  23.17 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.894864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.98 
 
 		 251 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>