More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1210 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1210  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3360  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.71 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00152445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.37 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.15 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.61 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  40.15 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  36.5 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  37.23 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  35.51 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.35 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.41 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.5 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.71 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  28 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  34.39 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.71 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  28.44 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  34.97 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  33.97 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.84 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  40.58 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.69 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.59 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.15 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.88 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  31.07 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  37.96 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.56 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  36.03 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0593  two component transcriptional regulator  34.48 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.123862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  38.69 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  37.23 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  35.03 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  35.04 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  33.81 
 
 		 242 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  37.96 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.5 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.15 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  41.61 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3127  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.23 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.674952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  29.67 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  40.88 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.51 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1809  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.2 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2784  two component transcriptional regulator  36.5 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2907  winged helix family two component transcriptional regulator  36.5 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00514074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0781  hypothetical protein  37.23 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  36.5 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  36.3 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.84 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  26.82 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.16 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.3 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  40.62 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  27.47 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  35.82 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2409  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.615174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  36.5 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  36.88 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.09 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.68 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2876  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.5251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3297  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  35.51 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.441835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.18 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  33.81 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.86 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.92 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>