More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3360 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3360  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00152445  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  37.17 
 
 		 223 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1210  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  37.71 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.22 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.78 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  36.97 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  34.2 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.74 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.74 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.23 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.74 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.74 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.74 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  31.56 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  31.98 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  33.19 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  33.48 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  29.58 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  33.04 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  30.53 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.33 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  30.97 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  30.97 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  30.97 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.09 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.56 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  33.19 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.63 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.86 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.72 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  31.74 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  34.5 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.08 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  31.08 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.11 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.86 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  33.99 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.48 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.89 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  32.74 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  31.11 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.16 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.74 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.08 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  31.88 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  31.56 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.63 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  31.56 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  31.56 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  31.25 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  31.56 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  31.44 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.42 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>