More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0593 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0593  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.123862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  77.93 
 
 		 244 aa  224  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  70.83 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.95 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.95 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 224 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  49.31 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.92 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.21 
 
 		 227 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47.92 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  49.66 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.55 
 
 		 229 aa  130  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.14 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  45.14 
 
 		 224 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  43.06 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  42.66 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 254 aa  124  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.52 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.52 
 
 		 228 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  45.07 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.19 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  46.21 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  44.76 
 
 		 242 aa  121  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  46.53 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.14 
 
 		 237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  43.45 
 
 		 248 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  43.45 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.4 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  40.41 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 406 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.07 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  43.36 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 237 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 233 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  42.07 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 255 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  117  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.96 
 
 		 238 aa  117  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  45.14 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.96 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0781  hypothetical protein  43.26 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  39.31 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  39.31 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  44.37 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.83 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  42.25 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  44.68 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.25 
 
 		 240 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 232 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  38.1 
 
 		 227 aa  114  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  42.66 
 
 		 241 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 		 236 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1614  two component transcriptional regulator  43.45 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.22 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>