66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1249 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  98.92 
 
 		 186 aa  376  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  97.04 
 
 		 186 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  82.8 
 
 		 186 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  91.62 
 
 		 186 aa  318  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  84.21 
 
 		 186 aa  304  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  82.46 
 
 		 186 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  82.46 
 
 		 186 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  76.61 
 
 		 186 aa  272  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  67.93 
 
 		 191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  66.49 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  69.09 
 
 		 191 aa  240  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  63.93 
 
 		 189 aa  235  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  56.99 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  52.73 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  53.33 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  48.37 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  41.14 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  37.95 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  38.95 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  34.34 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  32.53 
 
 		 183 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  32.53 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  35.09 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  35.67 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  30.54 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  29.31 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  31.77 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  32.4 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  32.98 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  34.32 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  26.47 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  27.08 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  31.03 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  32.57 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  29.95 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  27.89 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  30.69 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  28.25 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  26.63 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  30.11 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  29.83 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  29.83 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  25.49 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  28.49 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  26 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  36.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  25.17 
 
 		 431 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  36.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  34.48 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  25.13 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  27.51 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  24.26 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  27.45 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  26.47 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  25.27 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  37.29 
 
 		 195 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  25.33 
 
 		 178 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  29.29 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  29.29 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  29.29 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  29.29 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>