50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1281 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  54.55 
 
 		 186 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  58.18 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  58.18 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  57.58 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  52.2 
 
 		 190 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  55.69 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  51.61 
 
 		 189 aa  177  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  53.89 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  54.55 
 
 		 186 aa  175  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  53.33 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  53.33 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  52.98 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  47.8 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  50.6 
 
 		 183 aa  154  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  42.55 
 
 		 191 aa  137  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  36.78 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  36.21 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  36.69 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  34.13 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  33.85 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  29.94 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  28.48 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  29.53 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  29.38 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  29.78 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  29.79 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  30.21 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  32.35 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  32.35 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  26.06 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  26.06 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  28.96 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  32.54 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  29.31 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  29.61 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  25.58 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  28.96 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  26.79 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  28.12 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  26.63 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  27.7 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  27.13 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  24.43 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  26.51 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  26.51 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  32 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  34.78 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>