56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1327 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  377  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  70.11 
 
 
186 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  73.53 
 
 
186 aa  254  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  72.35 
 
 
186 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  72.35 
 
 
186 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  71.86 
 
 
186 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  71.26 
 
 
186 aa  245  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  71.26 
 
 
186 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  70.66 
 
 
186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  64.74 
 
 
191 aa  239  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  66.86 
 
 
189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  67.47 
 
 
186 aa  232  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  60.21 
 
 
190 aa  225  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  55.43 
 
 
186 aa  201  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  52.17 
 
 
187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  52.73 
 
 
195 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  46.96 
 
 
191 aa  158  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  51.5 
 
 
183 aa  158  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  43.35 
 
 
174 aa  148  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  39.33 
 
 
191 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  35.54 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  32.74 
 
 
185 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  36.26 
 
 
198 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  34.91 
 
 
184 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  34.36 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  36.05 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  36.05 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  34.39 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  34.86 
 
 
185 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  33.93 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  33.83 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  31.31 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  30.34 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  32.74 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  31.87 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  29.23 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  29.59 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  28.87 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  28.72 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  24.43 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  31.55 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  30.51 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  30.51 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  30.43 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  25.56 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  24.24 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  27.65 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  24.5 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  27.03 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  36.36 
 
 
210 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  34.48 
 
 
231 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  23.94 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  36.36 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  23.33 
 
 
431 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  27.61 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  24.87 
 
 
198 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>