48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1596 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  32 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  34.74 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  37.28 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  31.89 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  32.98 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  33.53 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  33.53 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  32.95 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  32.75 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  33.53 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  33.73 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  32.94 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  33.14 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  33.14 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  37.57 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  37.95 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  31.36 
 
 		 191 aa  90.9  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  34.32 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  34.12 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  36.63 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  36.63 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  29.61 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  27.12 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  33.51 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  31.61 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  31.22 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  30.86 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  30.11 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  29.47 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  28.87 
 
 		 226 aa  72  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  27.96 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  27.54 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  31.46 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  30.77 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  31.95 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  28.74 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  25.43 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  25.27 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  29.38 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  29.38 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  26.74 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  23.78 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  22.79 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33001  predicted protein  28.22 
 
 		 172 aa  44.7  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.285759  normal  0.382252 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37171  predicted protein  25.29 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  28.07 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>