57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1486 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  50.31 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  43.79 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  43.26 
 
 		 203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  46.76 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  40.99 
 
 		 190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  40.37 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  44.14 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  44.52 
 
 		 204 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  43.17 
 
 		 190 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  43.84 
 
 		 204 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  43.84 
 
 		 204 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  43.84 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  42.11 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  37.75 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  38.31 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  36.81 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  33.54 
 
 		 184 aa  97.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  34.56 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  35.15 
 
 		 175 aa  91.7  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  34.69 
 
 		 188 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  36.11 
 
 		 205 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  31.97 
 
 		 181 aa  87  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  35.51 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  34.76 
 
 		 178 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  31.87 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  34.76 
 
 		 237 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  31.72 
 
 		 176 aa  84  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  31.68 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  29.45 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  31.72 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  33.55 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  33.81 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  32.39 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  29.5 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  29.45 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  28.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  27.22 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  28.93 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  32.37 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  32.37 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  30.47 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  28.06 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  29.37 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  25.62 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  26.71 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  22.79 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  26.03 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  24.38 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  22.38 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  24.38 
 
 		 186 aa  43.9  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  25.62 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  26.32 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  24.38 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  24.38 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>