60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3061 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  99.02 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  98.53 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  97.55 
 
 		 204 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  75.52 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  67.79 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  58.79 
 
 		 190 aa  224  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  67.11 
 
 		 190 aa  222  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  58.24 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  48.28 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  47.45 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  42.47 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  43.84 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  41.79 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  38.85 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  40.94 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  36.84 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  41.38 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  36.99 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  33.55 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  36.59 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  92  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  37.76 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  32.65 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  30.5 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  29.33 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  29.38 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  29.51 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  31.97 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  31.97 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  36.3 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  32.45 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  31.39 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  29.5 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  30.48 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  31.43 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  30.5 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  29.87 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  29.79 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  30.43 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  29.05 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  29.93 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  27.1 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  26.56 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  26.85 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  29.52 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  26.67 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  28.17 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  32.35 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  21.32 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  32.35 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  29.29 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  29.29 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  29.29 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3136  hypothetical protein  45 
 
 		 154 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.771264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  29.29 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  29.29 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>