51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01820 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  74.14 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  50.93 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  40.14 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  37.18 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  36.84 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  38.26 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  36.84 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  34.87 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  36.42 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  33.54 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  30.29 
 
 		 190 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  30.29 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  40.27 
 
 		 203 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  35.37 
 
 		 183 aa  94.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  34.01 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  31.21 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  32.39 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  34.62 
 
 		 175 aa  87.8  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  31.97 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  31.72 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  31.54 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  33.12 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  33.76 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  30.52 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  31.18 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  29.73 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  29.68 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  28.1 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  27.7 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  29.68 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  26.88 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  25.81 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  27.03 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  24.84 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  25.42 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  26.67 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  30.13 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  26.54 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  25.99 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  25.33 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  29.75 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  25.84 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  25.84 
 
 		 186 aa  44.3  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  25.84 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  28.09 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  23.18 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  23.37 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>