64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03342 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  38.92 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  34.44 
 
 		 205 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  36.11 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  38.19 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  36.73 
 
 		 178 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  38.16 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  36.81 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  36.55 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  35.19 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  34.93 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  35.86 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  31.52 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  33.79 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  36.62 
 
 		 152 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  34.44 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  35.14 
 
 		 198 aa  98.6  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  31.72 
 
 		 175 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  33.95 
 
 		 237 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  31.38 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  34.56 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  33.56 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  32.61 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  38.06 
 
 		 183 aa  87.4  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  32.5 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  30.66 
 
 		 205 aa  84.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  32.61 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  31.91 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  30.82 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  31.16 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  31.16 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  31.16 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  30.66 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  30.52 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  30.83 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  28.08 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  27.52 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  29.33 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  30.41 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  25.17 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  27.33 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  26.75 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  27.4 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  27.4 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  23.78 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  22.22 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  26.71 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  26.85 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  26.85 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  25.34 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  24.08 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  25.34 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  28 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  25.5 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  25.15 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  24.83 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  25.68 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  24.06 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  18.62 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>