51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3109 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  72.93 
 
 		 189 aa  258  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  67.4 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  64.74 
 
 		 191 aa  248  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  69.28 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  69.28 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  70.3 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  70.3 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  69.7 
 
 		 186 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  68.67 
 
 		 186 aa  241  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  67.88 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  60.32 
 
 		 190 aa  228  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  66.67 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  58.79 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  48.65 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  53.29 
 
 		 195 aa  171  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  47.51 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  48.8 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  40.8 
 
 		 174 aa  137  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  38.79 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  38.95 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  38.74 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  31.36 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  33.93 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  33.93 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  34.95 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  32.74 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  32.16 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  32.31 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  31.44 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  32.76 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  31.89 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  30.28 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  29.21 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  32.11 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  26.32 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  28.25 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  31.98 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  31.07 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  29.1 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  28.57 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  29.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  30.23 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  30.23 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  28.74 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  24.23 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  26.32 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  28.17 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  26.52 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  34.48 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  25.91 
 
 		 198 aa  42  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>