69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1552 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  39.69 
 
 		 205 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  37.28 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  35.52 
 
 		 216 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  36.92 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  36.31 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  37.11 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  34.97 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  37.89 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  34.76 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  35.54 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  40.61 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  39.34 
 
 		 186 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  40.23 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  40.23 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  38.37 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  38.95 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  38.37 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  37.43 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  38.37 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  39.18 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  34.91 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  40 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  40 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  38.15 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  39.25 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  34.55 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  34.55 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  35.45 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  36.69 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  37.72 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  36.9 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  33.15 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  33.73 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  34.13 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  34.12 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  31.93 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  32.58 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  35.88 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  28.34 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  29.82 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  28.65 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  29.55 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  30.99 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  33.93 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  31.33 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  34.52 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  29.59 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  34.84 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  24.61 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  29.22 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  26.85 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  27.33 
 
 		 431 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  25.5 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26518  predicted protein  24.86 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.277816 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37171  predicted protein  28.49 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  26.75 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  26.21 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  27.78 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  28.03 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  26.82 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  24.68 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  26.09 
 
 		 190 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  26.09 
 
 		 190 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  26.45 
 
 		 190 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  27.45 
 
 		 184 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  28.19 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  23.98 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>