54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2339 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  52.38 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  51.58 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  53.29 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  48.96 
 
 		 191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  53.29 
 
 		 186 aa  161  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  50.8 
 
 		 186 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  53.29 
 
 		 186 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  52.98 
 
 		 186 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  52.69 
 
 		 186 aa  160  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  52.38 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  52.38 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  47.25 
 
 		 189 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  50.6 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  48.8 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  45.45 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  45.3 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  40.22 
 
 		 191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  38.79 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  37.13 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  35.88 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  30.54 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  33.92 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  33.92 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  34.5 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  30.54 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  28.49 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  30.43 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  31.75 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  28.74 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  30.53 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  27.17 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  26.74 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  27.42 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  25.88 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  29.35 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  28.57 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  29.76 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  29.76 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  24.58 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  45 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  27.46 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  26.71 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  27.08 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  23.13 
 
 		 411 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  26.37 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  26.55 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  40.68 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  28.19 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  24.18 
 
 		 196 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>