63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2984 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  98.39 
 
 
186 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  98.39 
 
 
186 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  98.39 
 
 
186 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  89.16 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  87.35 
 
 
186 aa  306  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  86.14 
 
 
186 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  86.75 
 
 
186 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  80.12 
 
 
186 aa  288  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  71.2 
 
 
191 aa  265  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  68.85 
 
 
189 aa  249  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  69.7 
 
 
191 aa  241  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  65.59 
 
 
190 aa  236  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  56.45 
 
 
186 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  57.58 
 
 
195 aa  185  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  49.73 
 
 
187 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  48.91 
 
 
191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  52.98 
 
 
183 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  44.24 
 
 
174 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  36.75 
 
 
191 aa  111  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  38.15 
 
 
191 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  33.53 
 
 
185 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  37.28 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  94.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  36.31 
 
 
184 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  36.31 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  31.96 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  35.26 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  31.03 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  32.54 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  34.32 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  29.34 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  32.54 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  30 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  27.75 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  26.63 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  31.25 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  32 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  31.25 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  32.57 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  33.14 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  32.57 
 
 
216 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  33.14 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  28.09 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  26.29 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  31.82 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  25.93 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  26.71 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  24.32 
 
 
212 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  37.93 
 
 
210 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  37.93 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  36.21 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  25.16 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  25.82 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  25.95 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  28.38 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  28.03 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  23.6 
 
 
431 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  23.27 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  25.69 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  24.2 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  23.81 
 
 
181 aa  41.2  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  26.47 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>