60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2970 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  98.92 
 
 
186 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  98.92 
 
 
186 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  98.39 
 
 
186 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  87.95 
 
 
186 aa  308  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  86.14 
 
 
186 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  84.94 
 
 
186 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  85.54 
 
 
186 aa  299  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  80.12 
 
 
186 aa  287  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  70.11 
 
 
191 aa  261  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  69.95 
 
 
189 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  70.3 
 
 
191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  66.13 
 
 
190 aa  239  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  55.91 
 
 
186 aa  207  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  58.18 
 
 
195 aa  186  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  50.27 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  49.46 
 
 
191 aa  168  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  52.38 
 
 
183 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  44.24 
 
 
174 aa  137  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  37.35 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  39.31 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  32.93 
 
 
185 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  37.87 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  37.43 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  34.91 
 
 
184 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  34.91 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  31.96 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  35.26 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  31.03 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  33.51 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  32.54 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  29.94 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  32.54 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  30.53 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  32.29 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  26.63 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  27.17 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  31.25 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  32 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  28.49 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  33.72 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  33.72 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  26.29 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  32 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  32 
 
 
216 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  32.37 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  26.54 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  23.78 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  37.93 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  36.21 
 
 
231 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  37.93 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  25.82 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  25.81 
 
 
174 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  25.64 
 
 
431 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  29.05 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  25.32 
 
 
195 aa  44.7  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  27.27 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  23.27 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  23.37 
 
 
181 aa  40.8  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>