68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2531 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  41.82 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  41.82 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  40.49 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  41.32 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  29.82 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  31.58 
 
 		 174 aa  94.4  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  30.96 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  29.32 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  30.29 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  30.91 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  30.05 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  29.82 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  28.98 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  30.81 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  31.14 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  32.29 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  31.03 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  26.47 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  32.02 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  30.95 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  30.95 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  26.47 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  25.88 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  29.44 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  28.1 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  31.33 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  30.95 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  27.81 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  25.29 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  24.74 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  27.91 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  27.62 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  32.95 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  26.32 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  24.85 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  26.2 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  31.79 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  26.49 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  26.77 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  27.17 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  25.45 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  24.74 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  25.88 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  26.04 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  29.09 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  24.55 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  28.48 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  26.53 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  24.16 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  26.54 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  30.88 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  28.43 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  26.21 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  23.49 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  26.03 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  22.86 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  24.85 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  23.96 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  32.86 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  23.29 
 
 		 203 aa  42  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  23.83 
 
 		 182 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  21.78 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>