59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1178 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  100 
 
 
185 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  57.83 
 
 
183 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  57.83 
 
 
184 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  57.83 
 
 
184 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  42.11 
 
 
192 aa  131  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  37.63 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  40.21 
 
 
196 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  35.87 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  34.59 
 
 
216 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  36.75 
 
 
216 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  35.14 
 
 
194 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  32.42 
 
 
195 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  31.87 
 
 
192 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  37.65 
 
 
198 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  34.38 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  32.07 
 
 
226 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  38.24 
 
 
191 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  36.69 
 
 
194 aa  98.2  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  34.78 
 
 
200 aa  97.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  35.12 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  35.12 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  38.82 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  34.3 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  38.46 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  34.22 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  34.22 
 
 
191 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  30.77 
 
 
189 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  32.31 
 
 
186 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  35.5 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  32.57 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  33.93 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  30.69 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  29.38 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  26.34 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  29.71 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  32.39 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  30.95 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  32.94 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  29.47 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  36.14 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  36.75 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  36.75 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  31.98 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  27.49 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  29.82 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  27.66 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  23.29 
 
 
162 aa  45.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  34.78 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  26.97 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  24.44 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  26.17 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  22.3 
 
 
431 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  25.93 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>