53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1227 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  381  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  46.3 
 
 
198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  37.09 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  32.69 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  32.89 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  31.45 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  29.22 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  28.33 
 
 
172 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  29.25 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  28.3 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  25.49 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  25.16 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  27.92 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  31.37 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  28.38 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  28.19 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  29.11 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  31.31 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  27.33 
 
 
183 aa  48.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  26.67 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  25.86 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  27.52 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  31.31 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  26.11 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  30.41 
 
 
180 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  29.17 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  27.52 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  28.66 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  25.84 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  28.67 
 
 
237 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  26.06 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  28.03 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  26.22 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  32.18 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  28.17 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  28.17 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  28.17 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  28.17 
 
 
204 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  25.48 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  24.18 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  27.61 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  29.17 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  23.53 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  25.16 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  30.61 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  27.33 
 
 
178 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>