55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1373 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  43.54 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  41.14 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  37.88 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  42.86 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  40.94 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  40.94 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  40.94 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  40.94 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  39.62 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  39.73 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  36.99 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  36.99 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  34.39 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  36.49 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  34.64 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  30.92 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  31.21 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  35.42 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  30.77 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  37.3 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  31.65 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  33.12 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  28.37 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  28.86 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  29.53 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  27.84 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  29.79 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  23.28 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  28.32 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  25.42 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  24.65 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  25.35 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  30.39 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  27.66 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  24.09 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  26.24 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  24.82 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  25.86 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  25.79 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  27.04 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  26.96 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  22.73 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  22.29 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  25.32 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  26.58 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  26.58 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  28.16 
 
 		 184 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  35.59 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>