60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3102 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  57.14 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  61.18 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  56.49 
 
 		 237 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  51.96 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  56.41 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  55.77 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  47.4 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  45.45 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  46.06 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  47.68 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  43.21 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  44.22 
 
 		 195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  42.11 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  40.41 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  34.48 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  36.41 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  43.88 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  38.55 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  40.82 
 
 		 152 aa  104  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  36.55 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  35.84 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  28.8 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  33.12 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  30.22 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  27.22 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  32.2 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  29.5 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  26.92 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  28.78 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  26.37 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  28.78 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  28.25 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  28.06 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  27.34 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  29.53 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  28.15 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  28.17 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  26.9 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  29.21 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  32.24 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  26.04 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  31.82 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  34.46 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  28.28 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  33.64 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  32.71 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  32.71 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  25.56 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  24.82 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  26.23 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  28.79 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  29.77 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  34.67 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  26.62 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  24.49 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  26.17 
 
 		 185 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  25.91 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  25 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>