43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0411 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  32.58 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  31.64 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  31.82 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  31.93 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  28.33 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  29.19 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  31.39 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  31.39 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  29.19 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  29.19 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  29.19 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  29.19 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  30.26 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  28.81 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  26.62 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  29.14 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  31.03 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  30.94 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  25.99 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  26.63 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  26.62 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  28.48 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  27.59 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  24.82 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  29.45 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  26.82 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  30.41 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  22.22 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  27.27 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  27.03 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  26.35 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  26.63 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  26.9 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  30.41 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  26.47 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  26.35 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  26.17 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  25.17 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  26.12 
 
 		 160 aa  42  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>