57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2729 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  98.88 
 
 		 178 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  65.29 
 
 		 184 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  56.49 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  51.79 
 
 		 172 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  51.76 
 
 		 172 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  57.52 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  41.67 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  39.63 
 
 		 170 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  43.04 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  43.24 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  39.39 
 
 		 184 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  40.61 
 
 		 190 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  42.25 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  41.14 
 
 		 195 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  35.71 
 
 		 184 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  42 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  37.02 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  42.14 
 
 		 152 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  35.42 
 
 		 186 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  41.01 
 
 		 183 aa  95.5  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  34.46 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  32.14 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  31.03 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  29.29 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  30.5 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  29.68 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  30.5 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  30.5 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  29.79 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  28.37 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  27.38 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  26.79 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  28.15 
 
 		 160 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  30.3 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  27.66 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  29.14 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  25.28 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  30.43 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  33.03 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  31.34 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  34.55 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  29.93 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  23.49 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  38.46 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  38.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  28.67 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  25.41 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  22.73 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  23.02 
 
 		 191 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>