49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1172 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  97.89 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  94.74 
 
 		 190 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  69.61 
 
 		 182 aa  275  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  68.53 
 
 		 204 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  68.53 
 
 		 204 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  68.53 
 
 		 204 aa  217  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  68.53 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  57.56 
 
 		 190 aa  208  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  44.32 
 
 		 183 aa  160  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  43.97 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  41.78 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  43.17 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  40.69 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  40.3 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  37.59 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  39.86 
 
 		 175 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  35.14 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  30.29 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  32.45 
 
 		 176 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  31.16 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  35.37 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  29.65 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  29.7 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  29.5 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  28.67 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  29.5 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  28.32 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  30.99 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  29.29 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  29.29 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  31.64 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  30.28 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  31.21 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  31.33 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  25.31 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  29.08 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  26.4 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  29.45 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  27.66 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  28.18 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  28.19 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  27.62 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  25.81 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>