60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1895 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  46.3 
 
 
191 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  33.55 
 
 
212 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  33.74 
 
 
188 aa  98.2  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  36.3 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  30.43 
 
 
196 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  27.13 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  25.44 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  24.26 
 
 
210 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  24.26 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  26.4 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  26.88 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  26.83 
 
 
183 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  26.83 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  25.31 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  22.56 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  26.46 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  28.76 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  27.32 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  28.86 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  25.5 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  26.47 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  24.26 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  27.03 
 
 
152 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  23.96 
 
 
194 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  25.6 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  24.87 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  26.42 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  26.01 
 
 
179 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  26.06 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  24.26 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  27.04 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  24.26 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  24.26 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  25.41 
 
 
237 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  24.84 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  24.86 
 
 
178 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  25.81 
 
 
190 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  24.57 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  23.16 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  23.16 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  25.81 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  23.27 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  24.23 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  23.16 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  24.34 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  23.78 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  24.85 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  23.27 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  26.17 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  23.27 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  23.27 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  22.92 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  25.68 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  25.66 
 
 
175 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  26 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  25.81 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  23.93 
 
 
186 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  25.33 
 
 
175 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  24.87 
 
 
191 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>