53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0233 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  51.04 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  50.93 
 
 		 205 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  47.73 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  43.12 
 
 		 198 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  43.71 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  39.57 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  36.76 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  39.89 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  42.39 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  39.36 
 
 		 237 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  38.42 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  42.11 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  40.51 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  40.13 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  41.03 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  39.87 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  38.96 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  38.96 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  35.98 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  40.85 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  36.36 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  32.65 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  32.65 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  28.8 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  29.19 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  27.43 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  30.07 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  31.17 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  30.07 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  26.52 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  30.67 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  31.97 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  28.67 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  26.24 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  24.71 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  28.83 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  28.29 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  28.77 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  25.9 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  27.62 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  30.19 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  27.04 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  26.92 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  33.85 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  32.86 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  24.68 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  32.05 
 
 		 231 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  26.67 
 
 		 188 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>