83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1925 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  98.57 
 
 
210 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  89.62 
 
 
231 aa  277  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  44.57 
 
 
188 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  40.45 
 
 
212 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  41.25 
 
 
203 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  40.99 
 
 
196 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  39.88 
 
 
185 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  34.02 
 
 
195 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  32.75 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  32.75 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  34.52 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  32.37 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  30.99 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  31.21 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  34.3 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  34.1 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  25.88 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  33.14 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  32.75 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  32.2 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  28.65 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  27.06 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  29.38 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  27.98 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  28.48 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  31.29 
 
 
184 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  35.14 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  32.74 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  31.79 
 
 
196 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  29.94 
 
 
226 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  32.53 
 
 
184 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  29.9 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  32.53 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  32.53 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  27.98 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  27.98 
 
 
186 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  27.98 
 
 
186 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  33.99 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  31.65 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  28.46 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  25.5 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  31.72 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  34.07 
 
 
194 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  36.59 
 
 
175 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  27.59 
 
 
189 aa  55.1  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  26.7 
 
 
191 aa  54.7  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  25.55 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  31.76 
 
 
431 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  39.71 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  24.4 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  33.88 
 
 
198 aa  52.4  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  31.03 
 
 
237 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  37.93 
 
 
186 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  41.54 
 
 
152 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  29.73 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  26.06 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  34.45 
 
 
175 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  28.3 
 
 
179 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  41.89 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  27.85 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  25.6 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  25.17 
 
 
190 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  27.86 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  27.7 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  28.17 
 
 
183 aa  45.1  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  35.29 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  34.87 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  26.06 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  25.35 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  38.33 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  26.06 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  25.35 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  25.35 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  26.06 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  24.11 
 
 
182 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  27.19 
 
 
175 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  31.97 
 
 
183 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  31.33 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>