53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0441 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  100 
 
 
199 aa  394  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  70.77 
 
 
200 aa  267  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  70.77 
 
 
200 aa  267  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  65.27 
 
 
198 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  64.67 
 
 
192 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  56.5 
 
 
195 aa  224  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  64.46 
 
 
194 aa  221  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  57.61 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  45.56 
 
 
196 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  38.01 
 
 
194 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  36.78 
 
 
205 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  36.69 
 
 
216 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  31.96 
 
 
216 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  31.96 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  29.29 
 
 
226 aa  91.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  32.54 
 
 
191 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  34.78 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  37.06 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  35.29 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  35.71 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  35.71 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  34.05 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  32.99 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  29.03 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  30.98 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  29.05 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  28.96 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  31.87 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  32.95 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  29.63 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  30.73 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  28.72 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  31.16 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  30.81 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  31.84 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  27.32 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  31.84 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  30.06 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  32.35 
 
 
210 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  32.34 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  32.56 
 
 
231 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  28.65 
 
 
183 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  26.35 
 
 
411 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  24.72 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  27.64 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  28.72 
 
 
184 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>