46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0655 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  393  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  42.13 
 
 		 191 aa  154  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  44.51 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  38.86 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  39.55 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  34.76 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  34.36 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  36.26 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  37.43 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  37.36 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  37.36 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  36.78 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  35.96 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  35.39 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  34.86 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  34.86 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  34.86 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  33.9 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  34.2 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  35.8 
 
 		 195 aa  89  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  30 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  33.14 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  30.81 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  26.01 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  30.81 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  31.98 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  29.65 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  30.34 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  27.72 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  26.6 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  28.73 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  28.41 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  27.47 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  30.5 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  25.79 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  30.15 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  22.47 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  26.78 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  27.53 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  28.42 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  28.42 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  25.62 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  26.78 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  25.95 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  26.62 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1596  hypothetical protein  25.76 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>