More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0985 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0985  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 593 aa  1227    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1926  phospholipase D/transphosphatidylase  24.07 
 
 		 582 aa  77.8  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  24.62 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  23.92 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3384  cardiolipin synthetase, putative  23.06 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  20.6 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  29.44 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  32.1 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  24.56 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  24.14 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  19.74 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1886  cardiolipin synthase  31.68 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.115754  hitchhiker  0.00782832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2886  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.33 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  19.91 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  19.91 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  28.69 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3563  cardiolipin synthetase 2  30.72 
 
 		 467 aa  67  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.483916 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  19.91 
 
 		 560 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  27.35 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1603  phospholipase D/transphosphatidylase  29.31 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420349  normal  0.113302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  24.42 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0412  phospholipase D/transphosphatidylase  28.14 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127464  hitchhiker  0.00000145574 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  23.69 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0095  phospholipase D family protein  24.63 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  22.66 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.37 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  29.63 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  30.46 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  21.18 
 
 		 535 aa  63.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1051  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.57 
 
 		 900 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  28.02 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0229  phospholipase D/transphosphatidylase  28.05 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  35.42 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1047  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.57 
 
 		 900 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  23.33 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.17 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  31.52 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  21.52 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  31.58 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.17 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  21.73 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  32.48 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.77 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  24.38 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.81 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  32.17 
 
 		 509 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  31.79 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  27.62 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0603365 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.07 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  26.92 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  23.09 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  26.92 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0990  phospholipase D/transphosphatidylase  35.53 
 
 		 900 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.96 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  22.22 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.66 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3170  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.64 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  31.41 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4772  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.58 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.93 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1256  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 		 625 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20488  normal  0.0365091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3962  cardiolipin synthetase 2  26.57 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  30.13 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  25.73 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.13 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.47 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.56 
 
 		 505 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 		 534 aa  57  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.56 
 
 		 505 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.22 
 
 		 524 aa  57  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  26.09 
 
 		 576 aa  57  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  29.82 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  25.14 
 
 		 486 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.05 
 
 		 420 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  30.13 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  31.88 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  26.02 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  30.67 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  31.47 
 
 		 505 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  32.68 
 
 		 486 aa  56.2  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.22 
 
 		 474 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.7 
 
 		 459 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0101  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.3 
 
 		 683 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0642638  normal  0.0241528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  26.64 
 
 		 529 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 		 481 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2014  cardiolipin synthetase  28.19 
 
 		 391 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0180  putative cardiolipin synthetase  28.19 
 
 		 391 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.43 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  25.85 
 
 		 484 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  27.27 
 
 		 575 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 		 495 aa  55.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>