More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4014 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  37.79 
 
 		 1012 aa  689    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  37.89 
 
 		 1012 aa  692    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4014  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1023 aa  2080    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0651  acriflavin resistance protein  94.23 
 
 		 1025 aa  1967    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0655  acriflavin resistance protein  94.33 
 
 		 1025 aa  1971    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3254  acriflavin resistance protein  93.6 
 
 		 1032 aa  1954    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0628  acriflavin resistance protein  94.23 
 
 		 1025 aa  1969    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3734  acriflavin resistance protein  94.23 
 
 		 1025 aa  1966    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  34.47 
 
 		 1022 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1022 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1198  RND efflux transporter  33.98 
 
 		 1022 aa  579  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  34.85 
 
 		 1036 aa  547  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.07 
 
 		 1024 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001981  RND multidrug efflux transporter  34.74 
 
 		 1040 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1024 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  34.54 
 
 		 1019 aa  542  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  34.34 
 
 		 1019 aa  540  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  34.63 
 
 		 1040 aa  538  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0929  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1033 aa  534  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0089  putative integral membrane component of multidrug efflux system  34.71 
 
 		 1022 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 		 1040 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1015 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1015 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  34.85 
 
 		 1023 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0465  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1025 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.471269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1025 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3269  putative multidrug resistance protein  34.08 
 
 		 1023 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  34.18 
 
 		 1032 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2244  AcrB/AcrD/AcrF cation/multidrug efflux pump  33.43 
 
 		 1030 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1034 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1064 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1034 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4150  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1027 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1029 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1031 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0357  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1030 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.37 
 
 		 1031 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  34.38 
 
 		 1035 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 		 1051 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1031 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1031 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1031 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2782  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.82 
 
 		 1036 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0804863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3802  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1058 aa  508  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578442  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1031 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1028 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1030 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0371  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1029 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1026 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1031 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1042 aa  506  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  33.59 
 
 		 1009 aa  505  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1029 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1031 aa  506  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1028 aa  505  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.3 
 
 		 1034 aa  505  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1031 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1638  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1047 aa  503  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0768  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 		 1032 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1024  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1037 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1034 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1027 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1031 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1711  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1047 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2236  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1047 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1024 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2411  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1013 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.848579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1029 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1026 aa  499  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2951  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1038 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1012 aa  496  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0615  cation/multidrug efflux protein  33.82 
 
 		 1038 aa  496  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1025 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1031 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  32.78 
 
 		 1029 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1031 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  33.01 
 
 		 1017 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  33.53 
 
 		 1029 aa  489  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1048 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  33.59 
 
 		 1014 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1025 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  33.3 
 
 		 1014 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1026 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  32.2 
 
 		 1068 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5960  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1017 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.618564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  33.24 
 
 		 1029 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  33.79 
 
 		 1018 aa  489  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3678  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1027 aa  489  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1155  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1025 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1046 aa  485  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1037 aa  486  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  33.5 
 
 		 1018 aa  485  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1040 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  32.92 
 
 		 1014 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  32.22 
 
 		 1025 aa  483  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7711  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1017 aa  482  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1035 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  31.93 
 
 		 1030 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  33.88 
 
 		 1014 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1041 aa  482  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>