110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2317 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2317    100 
 
 		 1176 bp  2331    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  87.21 
 
 		 2028 bp  83.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  86.75 
 
 		 1632 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.73 
 
 		 711 bp  77.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.11 
 
 		 1455 bp  75.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4372  methyl-accepting chemotaxis protein  84.38 
 
 		 1860 bp  71.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  87.5 
 
 		 1953 bp  71.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1937  methyl-accepting chemotaxis protein  84.21 
 
 		 1989 bp  69.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.21 
 
 		 1869 bp  69.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  87.32 
 
 		 1983 bp  69.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.49 
 
 		 1578 bp  67.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 1143 bp  65.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.33 
 
 		 1455 bp  65.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.234847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.33 
 
 		 1455 bp  65.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0806929  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.18 
 
 		 1455 bp  63.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.49 
 
 		 1722 bp  61.9  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.09 
 
 		 1863 bp  61.9  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  91.49 
 
 		 1953 bp  61.9  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  85.92 
 
 		 1983 bp  61.9  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  82.98 
 
 		 1926 bp  60  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  94.74 
 
 		 1707 bp  60  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4927  methyl-accepting chemotaxis protein/sensory box protein  90 
 
 		 1536 bp  60  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  88.89 
 
 		 1953 bp  60  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  88.89 
 
 		 1953 bp  60  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 1488 bp  60  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.3 
 
 		 1455 bp  60  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.3 
 
 		 1674 bp  60  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.418138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1035  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.89 
 
 		 1470 bp  60  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90 
 
 		 2070 bp  60  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03238  chemotaxis sensory transducer  92.86 
 
 		 1290 bp  60  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  88.89 
 
 		 1983 bp  60  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.53 
 
 		 1620 bp  58  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.53 
 
 		 1620 bp  58  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.68 
 
 		 1794 bp  58  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001512  aerotaxis sensor receptor protein  92.68 
 
 		 1551 bp  58  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.961146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 1716 bp  58  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00224736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  96.88 
 
 		 1983 bp  56  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 1137 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  100 
 
 		 1503 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0493  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.58 
 
 		 1476 bp  56  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.5 
 
 		 2028 bp  56  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0046  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.44 
 
 		 1692 bp  56  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1836  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.5 
 
 		 1080 bp  56  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126283  normal  0.522282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.29 
 
 		 1659 bp  56  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.21 
 
 		 1488 bp  56  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 2058 bp  56  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0040  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 285 bp  56  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000117036  normal  0.121985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3839  methyl-accepting chemotaxis protein  87.27 
 
 		 1911 bp  54  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.406017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.11 
 
 		 1602 bp  54  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.36 
 
 		 1869 bp  54  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.29 
 
 		 1545 bp  54  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.42 
 
 		 1569 bp  54  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.51 
 
 		 2136 bp  54  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.51 
 
 		 1815 bp  54  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  87.27 
 
 		 1977 bp  54  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  84.51 
 
 		 1983 bp  54  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  89.36 
 
 		 1983 bp  54  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3929  methyl-accepting chemotaxis protein  92.11 
 
 		 1518 bp  52  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4692  methyl-accepting chemotaxis protein  88 
 
 		 1602 bp  52  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2117  methyl-accepting chemotaxis protein  92.11 
 
 		 1134 bp  52  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  100 
 
 		 720 bp  52  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  85.48 
 
 		 1494 bp  52  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1214  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  88 
 
 		 1584 bp  52  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.48 
 
 		 1446 bp  52  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.13 
 
 		 2022 bp  52  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.603679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.63 
 
 		 1614 bp  52  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000516027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  92.11 
 
 		 1143 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0952292  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  85.48 
 
 		 1677 bp  52  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  92.11 
 
 		 1143 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0668336  normal  0.991447 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3454  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88 
 
 		 1743 bp  52  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000893218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  92.11 
 
 		 2037 bp  52  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2678  methyl-accepting chemotaxis protein  90.48 
 
 		 1602 bp  52  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  92.11 
 
 		 1143 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  83.56 
 
 		 1986 bp  50.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2660  methyl-accepting chemotaxis protein  91.89 
 
 		 1131 bp  50.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0865611  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0084    100 
 
 		 1988 bp  50.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0143    100 
 
 		 228 bp  50.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0146    100 
 
 		 2461 bp  50.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0356  chemotaxis sensory transducer  93.94 
 
 		 1959 bp  50.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.12 
 
 		 1629 bp  50.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.79 
 
 		 2007 bp  50.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.25 
 
 		 2118 bp  50.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.06 
 
 		 1695 bp  50.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.24 
 
 		 1602 bp  50.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.24 
 
 		 1974 bp  50.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1860  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  90.24 
 
 		 1575 bp  50.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.06 
 
 		 2025 bp  50.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0527458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3867  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.24 
 
 		 1719 bp  50.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  93.75 
 
 		 1983 bp  48.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  87.5 
 
 		 1977 bp  48.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  93.75 
 
 		 1983 bp  48.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  87.5 
 
 		 1977 bp  48.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  93.75 
 
 		 1983 bp  48.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  87.5 
 
 		 1977 bp  48.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  93.75 
 
 		 1983 bp  48.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0995  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 1554 bp  48.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90 
 
 		 1866 bp  48.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022904  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1141  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 2022 bp  48.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0337081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  93.75 
 
 		 1302 bp  48.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.64 
 
 		 1455 bp  48.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19262  hitchhiker  0.00019204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>