19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0084 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0084    100 
 
 		 1988 bp  3941    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0146    99.15 
 
 		 2461 bp  2476    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0082    100 
 
 		 321 bp  636  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3034    90.2 
 
 		 615 bp  369  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0365  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 909 bp  242  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1766  hypothetical protein  100 
 
 		 648 bp  73.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4166  hypothetical protein  100 
 
 		 582 bp  73.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2810    100 
 
 		 333 bp  61.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1313    97.14 
 
 		 435 bp  61.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0145  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 645 bp  60  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2317    100 
 
 		 1176 bp  50.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4676  hypothetical protein  100 
 
 		 705 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  91.11 
 
 		 312 bp  50.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0143    100 
 
 		 228 bp  50.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  100 
 
 		 1503 bp  50.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  100 
 
 		 720 bp  50.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 1137 bp  50.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  93.75 
 
 		 621 bp  48.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  96.43 
 
 		 960 bp  48.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>