14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4166 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4166  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0761  hypothetical protein  32.37 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.569616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1355  hypothetical protein  31.52 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00228455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2709  hypothetical protein  29.88 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0324034  normal  0.326043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0122  hypothetical protein  34.95 
 
 		 272 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.198033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37290  hypothetical protein  29.82 
 
 		 284 aa  71.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3775  hypothetical protein  27.54 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4391  hypothetical protein  27.49 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1152  hypothetical protein  26.86 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4343  hypothetical protein  27.85 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226575  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3133  hypothetical protein  25.73 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1265  hypothetical protein  29.41 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0342627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0116  hypothetical protein  25.15 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1793  hypothetical protein  25.77 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.211378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>