17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1313 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1313    100 
 
 		 435 bp  862    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2526    79.44 
 
 		 527 bp  125  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.145452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2616  transposase  84.81 
 
 		 288 bp  123  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3213    83.89 
 
 		 288 bp  105  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00049736  hitchhiker  0.00412529 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1324    81.41 
 
 		 581 bp  101  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1417    80.4 
 
 		 431 bp  85.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0084    97.14 
 
 		 1988 bp  61.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  92.31 
 
 		 780 bp  54  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3034    94.29 
 
 		 615 bp  54  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0537    84.62 
 
 		 583 bp  50.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0270253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  96.3 
 
 		 693 bp  46.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  96.3 
 
 		 693 bp  46.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  88.37 
 
 		 558 bp  46.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  88.37 
 
 		 546 bp  46.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  88.37 
 
 		 558 bp  46.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  96.3 
 
 		 693 bp  46.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  96.3 
 
 		 693 bp  46.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>