117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2213.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2213.1  glucose-galactose transporter  100 
 
 		 92 aa  189  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  78.26 
 
 		 423 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  78.26 
 
 		 423 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  78.26 
 
 		 423 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  70.65 
 
 		 423 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  70.65 
 
 		 423 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  70.65 
 
 		 423 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  70.65 
 
 		 423 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  70.65 
 
 		 423 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  68.48 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  67.44 
 
 		 415 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  64.89 
 
 		 424 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  65.48 
 
 		 421 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  55.32 
 
 		 431 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  65.33 
 
 		 407 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  61.25 
 
 		 428 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  54.26 
 
 		 431 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  72.22 
 
 		 415 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  59.78 
 
 		 415 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  54.26 
 
 		 431 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  54.35 
 
 		 435 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  58.62 
 
 		 420 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  55.43 
 
 		 435 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  58.02 
 
 		 410 aa  103  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  63.64 
 
 		 436 aa  100  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  53.33 
 
 		 424 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  64.38 
 
 		 428 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  55.13 
 
 		 435 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  63.01 
 
 		 425 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  58.82 
 
 		 426 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  58.82 
 
 		 426 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  60.29 
 
 		 437 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  56.94 
 
 		 427 aa  87.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  62.5 
 
 		 468 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  54.79 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  59.15 
 
 		 428 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  76.09 
 
 		 413 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  77.78 
 
 		 389 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  44.44 
 
 		 436 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  70 
 
 		 403 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  50.7 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  46.05 
 
 		 440 aa  67  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  45.21 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  43.75 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  51.39 
 
 		 431 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  41.33 
 
 		 412 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  43.42 
 
 		 428 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  43.06 
 
 		 417 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  52.08 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  36.11 
 
 		 425 aa  52.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  39.66 
 
 		 413 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  35.11 
 
 		 458 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  45 
 
 		 434 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 426 aa  50.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  34.78 
 
 		 438 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  34.78 
 
 		 438 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  34.78 
 
 		 438 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  34.78 
 
 		 438 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  34.78 
 
 		 438 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  28.74 
 
 		 409 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  34.78 
 
 		 438 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  44.64 
 
 		 417 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  38.57 
 
 		 417 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 488 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  33.78 
 
 		 417 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  49.23 
 
 		 408 aa  47.4  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  49.23 
 
 		 408 aa  47.4  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 452 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  31.4 
 
 		 414 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  33.7 
 
 		 438 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  33.7 
 
 		 438 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  33.7 
 
 		 438 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  33.7 
 
 		 438 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  33.7 
 
 		 438 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 452 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 452 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  39.13 
 
 		 431 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4073  L-fucose:H+ symporter permease  38.67 
 
 		 438 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4123  L-fucose:H+ symporter permease  38.67 
 
 		 438 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4002  L-fucose:H+ symporter permease  38.67 
 
 		 438 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4018  L-fucose:H+ symporter permease  38.67 
 
 		 438 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4181  L-fucose:H+ symporter permease  38.67 
 
 		 438 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  39.13 
 
 		 448 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  33.33 
 
 		 432 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.31 
 
 		 438 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  35.06 
 
 		 431 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  48 
 
 		 421 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 435 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  37.33 
 
 		 424 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  37.7 
 
 		 444 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 432 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  36.62 
 
 		 468 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  52.63 
 
 		 446 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  35.94 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>