More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1517 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1517  peptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 
314 aa  629  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0892192  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  39.09 
 
 
314 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  39.09 
 
 
314 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  39.68 
 
 
310 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  38.19 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  38.72 
 
 
319 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  37.22 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2401  nickel transporter permease NikB  41.79 
 
 
313 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  38.41 
 
 
314 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  38.41 
 
 
314 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  38.41 
 
 
314 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  38.41 
 
 
314 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  38.41 
 
 
314 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  38.41 
 
 
314 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  38.41 
 
 
314 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  38.41 
 
 
314 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  38.41 
 
 
314 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1322  nickel transport system permease protein NikB  37.67 
 
 
310 aa  206  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00196564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1835  nickel transporter permease NikB  37.83 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  hitchhiker  0.0019148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  35.9 
 
 
316 aa  195  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 
316 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  36.54 
 
 
316 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
314 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
316 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
316 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
316 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
316 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
312 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  35.9 
 
 
316 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  34.19 
 
 
316 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.9 
 
 
316 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.184188  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  34.42 
 
 
316 aa  189  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
306 aa  188  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  34.2 
 
 
311 aa  186  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3006  nickel transporter permease NikB  37.37 
 
 
313 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0438476  normal  0.3014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3343  nickel transporter permease NikB  37.85 
 
 
313 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.96 
 
 
305 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 
309 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
311 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
306 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1283  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000188378  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04490  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.86 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.01 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0953  peptide ABC transporter, permease protein, putative  32.67 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.353357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.9 
 
 
306 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
325 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.9 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.9 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  32.9 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.9 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.9 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5290  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  31.25 
 
 
307 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
308 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
329 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
321 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
313 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.650812  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
315 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
324 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
318 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.57 
 
 
306 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.18 
 
 
316 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
320 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
306 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  31.71 
 
 
325 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
313 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.71 
 
 
307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
326 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  32.57 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  32.57 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
311 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000854239  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
311 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  32.25 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  32.25 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.87491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
326 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
320 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
313 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
306 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>