78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0906 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2230  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0906  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2263  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  90.38 
 
 		 104 aa  190  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.911956  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  36.36 
 
 		 844 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.65 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  38.71 
 
 		 842 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 602 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  33.01 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  44.32 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  44.32 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38 
 
 		 849 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  31.31 
 
 		 856 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  39.36 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  32.63 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  35.35 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  40.45 
 
 		 855 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  36.36 
 
 		 852 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  42.17 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  40.45 
 
 		 856 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  35.11 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  35.42 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  35.23 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 1067 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  35.96 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.68 
 
 		 844 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  30.11 
 
 		 822 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  40 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  36.36 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  41.33 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  42.86 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.35 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  41.67 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1111 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.03 
 
 		 847 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  29.81 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  36.26 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  36.14 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2091  two component transcriptional regulator, LytTR family  36 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  normal  0.478744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  30.77 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 639 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  34.74 
 
 		 1096 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  36.26 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2651  response regulator  30 
 
 		 125 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00566392  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 559 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  38.03 
 
 		 847 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 551 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  34.65 
 
 		 429 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 254 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  33.68 
 
 		 847 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 728 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  33 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  36.51 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.21 
 
 		 846 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  29.7 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  33.72 
 
 		 104 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 792 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  26.6 
 
 		 139 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.36 
 
 		 635 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>